Csak akkor érdemes és szabad antibiotikumot szedni, ha a betegséget baktérium okozta. A náthát, a torokgyulladást és legtöbbször a hasmenést is vírusok okozhatják, így ekkor az antibiotikum szedése csak felerősíti a vírusok ellenállóképességét, és a szervezetben élő hasznos baktériumokat elpusztítja.
Az antibotikum kúra alatt és utána pár napig érdemes naponta legalább kétszer élőflórás joghurtot fogyasztani. A kálciumban gazdag élelmiszerek gátolhatják egyes antibiotikumok (pl. penicilin, tetraciklin, penicillamin) felszívódását, ezért érdemes az orvos tanácsát kikérni. Emellett rendelkezésre állnak a bélflóra egyensúlyát helyreállító szerek, mint pl. a [Normaflore]?