A védekezési rendszer reagál az idegenként felismert molekulákra. Ezeket antigéneknek nevezik. Baktériumok (amilyen a szalmonella), vírusok (B típusú hepatitiszvírus) mérgek és egyéb anyagok (pl. allergiát keltő vegyületek) egyaránt antigének lehetnek. Antigént kimutató vizsgálattal állapítják meg, hogy milyen idegen anyag okozza az ember betegségét vagy egyéb reakcióját.
Az antigén felbukkanásakor különböző immunválaszok jelennek meg, amelyek mind kimutathatók. Igen fontosak azok az antigén vizsgálatok, amelyekkel a környezetben fellelhető allergizáló anyagok által kiváltott reakciók azonosíthatók. Ilyen allergizáló anyag a macska és a kutya szőre, a toll, a házi poratka, a csótány, a különböző penészek, valamint a füvek, a gyomok és a fák virágpora. Az allergiás válasz vizsgálatához egy kevés antigént fecskendeznek be vagy dörzsölnek be a bőr felszíni rétegei közé, s megnézik, hogy harminc-hatvan perccel később mekkora bőrterület lett vörös, illetve mekkora göb képződött. Egyszerre több antigént is vizsgálnak. Az allergiára hajlamos személy gyakran több antigénre is érzékenyek.